Чревният микробиом е комплексна и динамична екосистема, състояща се от голямо разнообразие от микроорганизми, сред които бактерии, гъбички, археи и вируси. Те взаимодействат както помежду си, така и с човешкия организъм, участвайки в много физиологични процеси. Добре известно е, че общият брой на микробните клетки в човешкия организъм надхвърля броя на човешките клетки многократно. Освен това общият брой на микробните гени е стотици пъти по-голям от общия брой на гените в човешкия организъм. Това обяснява разнообразната роля и функции на микробиома.
Обособяването на видовото разнообразие от микроорганизми, влизащи в състава на чревния микробиом, започва още от раждането и продължава да се развива в ранните периоди от израстването на организма. Това е ключов период за развитие на чревния микробиом. Много фактори именно в този период са от значение за развитието на добре балансиран микробиом с видово разнообразие от микроорганизми, подпомагащи в положителен аспект биохимичните и физиологични процеси в организма.
Компонентен състав на чревния микробиом
Нормално чревният микробиом е представен от голямо разнообразие от микроорганизми, които са предимно представители на три групи: Actinobacteria, Firmicutes и Bacteroidetes.
Actinobacteria са представени от род Bifidobacterium и клас Coriobacteriia. Бифидобактериите са първите микроорганизми, колонизиращи чревния микробиом след раждането и доминират в първите няколко месеца. В последствие се заселват разнообразни видове бактерии, но бифидобактериите играят важна бариерна роля, предпазвайки колонизацията от патогени в чревния тракт в периода след раждането.
Firmicutes – представителите са предимно от клас Clostridia, които са най-разпространената група бактирии в чревния тракт. Представителите на този клас могат да бъдат както представители на нормалния микробиом, участващи в разграждането на белтъци и мазнини, така и опортюнистични и дори патогенни бактерии.
Bacteroidetes – съставляват най-голямата част от микробиома при деца над двегодишна възраст. Имат важна роля в метаболизма на полизахаридите. Освен това са основните производители на противовъзпалителни късо-верижни мастни киселини и секретират метаболити, участващи в регулацията на функциите на нервната и имунната система.
Динамика на развитие на чревния микробиом
Динамиката на формиране на чревната флора при деца зависи от гестационната възраст, начина на раждане, типът хранене и прием на антибиотици, затова съставът ѝ може да се различава при деца на една и съща възраст.
Чревната флора при деца, които са естествено родени, се характеризира с ниско разнообразие, но стабилен състав, поради контакта между детето и представители на вагиналния, кожния и фекалния микробиом на майката по време на раждането. При деца, родени с цезарово сечение, формирането на чревния микробиом отнема повече време, освен това при тях по-често се срещат опортюнистични микроорганизми, като Clostridium difficile, Enterococcus spp., Klebsiella spp., Streptococcus spp. и Veillonella spp.
- В периода на кърмене чревният микробиом е представен предимно от Bifidobacterium spp. (в частност Bifidobacterium breve, Bifidobacterium bifidum и Bifidobacterium longum), както и Lactobacillus spp., Streptococcus spp., Enterococcus spp. и Lactococcus spp. При деца, хранени по изкуствен начин, чревната флора е доминирана от анаероби от родовете Bacteroides и Clostridium, а количеството на бифидобактериите е понижено.
- Гестационната възраст е друг ключов фактор, който има ефект върху формирането на чревния микробиом. При преждевременно родени деца, развитието на храносмилателната и имунната система не е завършено. Хоспитализацията, изкуственото хранене и приемът на антибиотици, които обикновено са необходими при тези деца, могат да доведат до необратими промени в естествените процеси на колонизиране на червата и развитие на чревния микробиом. В частност, преждевременно родените деца имат късна колонизация на анаероби и при тях микробиомът е представен предимно от Enterobacteriaceae, Enterococcus и други опортюнистични микроорганизми.
- Приемът на антибиотици намалява цялостното разнообразие на микробиома и води до развитието на бактерии, резистентни към антибиотици, както и на потенциално патогенни бактерии от родовете Enterobacteriaceae и Clostridium, като в същото време намалява количеството на Bifidobacteriaceae, Bacilli и Lactobacillus..
Enteroflor® Kiddy за комплексна количествена оценка на чревния микробиом при деца от 0 до 14г.
Enteroflor® Kiddy детектира и определя количествено 99,9% от микроорганизмите, включени в състава на чревния микробиом при деца, използвайки Real-Time PCR технология.
Предимства на метода:
Определяне статуса на чревния микробиом (нормоценоза/дисбиоза) чрез определяне на съотношението на нормална, ползотворна и опортюнистична микрофлора.
Оценка на разнообразието в нормалния микробиом
Определяне на количество бифидобактерии и лактобацили
Определяне на видове бифидобактерии
Изчисляване на съотношението Firmicutes/Bacteroidetes
Оценка на присъствието на представители от таксон Bacteroidetes
Детекция на маркери за патогенност и резистентност: mecA, srr2, tcdA, tcdB
Мултиплексен формат – няколко ДНК мишени се откриват едновременно в една тестова епруветка
Вътрешна контрола – за оценяване качеството на ДНК екстракцията и PCR
Автоматично генериране на резултати при използване на препоръчителните Real-time PCR апарати от серията DT и RealTime_PCR софтуер.
Наличие на предварително зададени програми, които автоматично настройват параметрите на теста и калкулират резултатите.
